Cloning of a Functional Vitamin D Receptor from the Lamprey (Petromyzon marinus), an Ancient Vertebrate Lacking a Calcified Skeleton and Teeth
Notice bibliographique
Résumé
The nuclear vitamin D receptor (VDR) mediates the actions of its 1,25-dihydroxyvitamin D(3) ligand to control gene expression in terrestrial vertebrates. Prominent functions of VDR-regulated genes are to promote intestinal absorption of calcium and phosphate for bone mineralization and to potentiate the hair cycle in mammals. We report the cloning of VDR from Petromyzon marinus, an unexpected finding because lampreys lack mineralized tissues and hair. Lamprey VDR (lampVDR) clones were obtained via RT-PCR from larval protospleen tissue and skin and mouth of juveniles. LampVDR expressed in transfected mammalian COS-7 cells bound 1,25-dihydroxyvitamin D(3) with high affinity, and transactivated a reporter gene linked to a vitamin D-responsive element from the human CYP3A4 gene, which encodes a P450 enzyme involved in xenobiotic detoxification. In tests with other vitamin D responsive elements, such as that from the rat osteocalcin gene, lampVDR showed little or no activity. Phylogenetic comparisons with nuclear receptors from other vertebrates revealed that lampVDR is a basal member of the VDR grouping, also closely related to the pregnane X receptors and constitutive androstane receptors. We propose that, in this evolutionarily ancient vertebrate, VDR may function in part, like pregnane X receptors and constitutive androstane receptors, to induce P450 enzymes for xenobiotic detoxification.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».