A method for creating a non-equilibrium NT(P1−P2) ensemble in molecular dynamics simulation
Notice bibliographique
Résumé
A method is proposed for creating a non-equilibrium ensemble with a constant number of molecules, constant temperature and constant pressures with different target values in two reservoirs [referred to as NT(P(1)-P(2)) ensemble] that are connected by a finite length nanopore. This method includes two steps. The first step places a partition between the two reservoirs and then creates a static pressure field and a proper system volume by using two self-adjusting plates on which two external forces/pressures with different target values are exerted. The second step removes the partition and the two self-adjusting plates and the pressure difference between the two reservoirs is maintained by a "pump" designed to simultaneously create a periodic boundary condition between the two reservoirs and supply the necessary force (work) to a subset of molecules for a steady state flow. To examine this method, several cases using liquid argon with a truncated and shift Lennard-Jones potential under different target pressures and pump sizes were studied. Results show that the method proposed in this paper works well. In addition, the method proposed in this paper was compared with the other external force field methods. The results show that as long as the external force is applied to a restricted set of molecules away from the channel a constant pressure difference between two reservoirs is maintained. The advantage of the algorithm proposed here also sets the absolute pressures with different target levels in two reservoirs instead of it being arbitrary. Studies show that the fluid flow rate or permeability through a nanopore depends not only on the pressure difference between two reservoirs, but also on the absolute pressures in two reservoirs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».