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Enregistrement W2003372369 · doi:10.1016/j.jalz.2013.05.684

P2–042: Characterizing upregulated miRNAs during preclinical prion disease: Possible role in neuroprotection

2013· article· en· W2003372369 sur OpenAlexaff
Anna Majer, Yulian Niu, Stephanie A. Booth

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeurodegenerationmicroRNANeuroprotectionBiologyDownregulation and upregulationGeneMicroarray analysis techniquesGene expressionTranscription factorRegulation of gene expressionCell biologyNeuroscienceDiseaseComputational biologyGeneticsMedicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Similar to Alzheimer's disease, prion diseases are another type of neurodegenerative disorders where the buildup of normal host protein leads to neuronal toxicity. More specifically, the infectious prion protein (PrPSc), which has a different conformation than the normal cellular prion protein (PrPC) accumulates in the brain resulting in degeneration. Both Alzheimer's and prion diseases exhibit pre-clinical pathological features involving synaptic dysfunction and dendrite degeneration. Using transcriptional gene expression profiling we recently found that neurons initiate a protective response during pre-clinical prion infection. This protective effect decreased with disease progression and was completely abolished during clinical disease. To enhance our understanding of this protective process we further investigated temporal changes in RNA regulatory molecules called microRNAs (miRNAs). MiRNAs are a major class of post-transcription gene regulators that function in two main capacities: as rheostats that fine tune a few gene targets whose levels are critically important for function or as molecular switches by regulating vital transcription factors which govern entire pathways. Further understanding of the involvement of miRNAs will illuminate these neuroprotective pathways. Interestingly, we found the upregulation of 7 miRNAs in prion-induced neurodegeneration of which 3 (miR-29a-5p, miR-124a-5p, miR-132–3p) have known neurprotective effects. We are currently characterizing neuronal-specific function in the remaining 4 deregulated miRNAs. Bioinformatic prediction programs were employed to curate a list of potential miRNA targets which was further refined using mRNA microarray data. Luciferase assays were employed to validate these predictions. Functional screens of candidate miRNAs were initiated on mouse post-mitotic primary hippocampal cultures to test effects of these miRNAs on neuron morphology (i.e. dendrite complexity and spine morphology). The function of 4 deregulated miRNAs has been implicated in dendrite formation and neuronal survival. Luciferase reporter assays are underway to confirm these predictions. The effect of these miRNAs on neuronal morphology is being tested. We are currently investigating potential neuroprotective roles of 4 miRNAs that were upregulated during pre-clinical disease. This study will enhance our repertoire of known neuroprotective miRNAs which could be useful avenues for therapy (i.e. manipulating the concentration of these miRNAs in prion infected animals may affect disease progression).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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