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Enregistrement W2003380203 · doi:10.1021/jp049531q

Copper-Mediated Peptide Radical Ions in the Gas Phase

2004· article· en· W2003380203 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésChemistryProtonationAmideStereochemistryTryptophanAmine gas treatingResidue (chemistry)Peptide bondDissociation (chemistry)Side chainMethyleneProton affinityPeptideMedicinal chemistryAmino acidIonOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molecular radical cations, M •+, of amino acids and oligopeptides are produced by collision-induced dissociation of mixed complex ions, [Cu II (dien)M] •2+, that contain Cu II, an amine, typically diethylenetriamine (dien), and the oligopeptide, M. With dien as the amine ligand, abundant M •+ formation is observed only for the amino acids tryptophan and tyrosine, and oligopeptides that contain either the tryptophanyl or tyrosyl residue. Dissociation of the M •+ ion is rich and differs considerably from that of protonated amino acids and peptides. Facile fragmentation occurs around the α-carbon of the tryptophanyl residue. Cleavage of the N−C α bond and proton transfer from the exocyclic methylene group in the side chain to the N-terminal residue results in formation of the [z n − H] •+ ion and elimination of the N-terminal fragment as ammonia or an amide, depending on the position of the tryptophanyl residue. Cleavage of the C α −C bond of an oligopeptide containing a C-terminal tryptophan residue and proton transfer from the carboxylic group to the N-terminal fragment (a carbonyl oxygen atom) results in formation of the [a n + H] •+ ion and elimination of carbon dioxide. Both types of fragmentation have no analogous reactions in protonated peptides. For the M •+ of tryptophanylglycylglycine, WGG, elimination of the tryptophanyl side chain results in GGG •+ . This radical cation fragments by eliminating its C-terminal glycine to give the [b 2 − H] •+ ion, which is an oxazolone and shares much of the structure and reactivity of the b 2 + ion from protonated triglycine. Density functional theory shows the mechanism of forming the [b 2 − H] •+ ion is similar to that of the b 2 + ion, although the free-energy barrier at 29.4 kcal/mol is lower. The [b 2 − H] •+ ion eliminates CO readily to give the [a 2 − H] •+ ion, which is an iminium radical ion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,580

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle