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Enregistrement W2003400355 · doi:10.2478/s11535-007-0040-z

Proteomics of RNA polymerase II holoenzymes during P19 cardiomyogenesis

2007· article· en· W2003400355 sur OpenAlex
Olivier Maës

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueOpen Life Sciences · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleolinRNA polymerase IICell biologyBiologyMolecular biologyTranscription (linguistics)Messenger RNATranscription factorChemistryBiochemistryGene expressionGeneNucleolusCytoplasmPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The embryonal carcinoma P19 model has allowed the elucidation of a role for several transcription factors in cell differentiation. Here, the regulation of the RNA polymerase II machinery has been explored through its association with multifunctional complexes involved in transcription. An interaction proteomics analysis of TFIIS-purified RNA polymerase II (RNAPII) holoenzymes during cardiomyogenesis is described. Modifications of protein complexes that may be associated with transcriptionally active and activator responsive RNAPII holoenzymes were detected in a serum and DMSO dependent manner. Subunits of the PAF1 and Mediator complexes were correlated with holoenzymes from non-differentiated and terminally differentiated P19 cultures respectively. Moreover, high levels of nucleolin were identified in all forms of holoenzymes by two-dimensional gel electrophoresis, and suggest that nucleolin could bind to RNAPII and TFIIS. Several proteins that were identified in the RNAPII holoenzymes are known to have functions in mRNA processing and may bind to nucleolin. A novel function for nucleolin is proposed as a possible pivotal platform between transcription, mRNA processing and export.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,281

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle