Proteomics of RNA polymerase II holoenzymes during P19 cardiomyogenesis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The embryonal carcinoma P19 model has allowed the elucidation of a role for several transcription factors in cell differentiation. Here, the regulation of the RNA polymerase II machinery has been explored through its association with multifunctional complexes involved in transcription. An interaction proteomics analysis of TFIIS-purified RNA polymerase II (RNAPII) holoenzymes during cardiomyogenesis is described. Modifications of protein complexes that may be associated with transcriptionally active and activator responsive RNAPII holoenzymes were detected in a serum and DMSO dependent manner. Subunits of the PAF1 and Mediator complexes were correlated with holoenzymes from non-differentiated and terminally differentiated P19 cultures respectively. Moreover, high levels of nucleolin were identified in all forms of holoenzymes by two-dimensional gel electrophoresis, and suggest that nucleolin could bind to RNAPII and TFIIS. Several proteins that were identified in the RNAPII holoenzymes are known to have functions in mRNA processing and may bind to nucleolin. A novel function for nucleolin is proposed as a possible pivotal platform between transcription, mRNA processing and export.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».