Bias and precision of algorithms in estimating the cross-sectional area of rat tail tendons
Notice bibliographique
Résumé
The cross-section area (CSA) of rat tail tendons (RTTs), a common experimental model in biomechanics and mechanobiology, is often approximated using circle or ellipse models. This assumption may nevertheless be faulty given the sensitivity of the mechanical properties on CSA estimation. To investigate this issue, we designed a new optic micrometer to be used under a stereomicroscope. Images of specimen projections were captured at angular increments and specimen edges were localized within a local reference frame using an image analysis algorithm based on contrast. The cross-sectional areas estimated using four algorithms (single measurement circle, multiple measurement circle, two degrees of freedom ellipse, three degrees of freedom ellipse) were compared to those obtained using the best algorithm currently described in the literature: the profile reconstruction algorithm. We showed that the four tested algorithms exhibit moderate but uniform bias (mean systematic error between 7 and 11%) with very non-uniform precision, varying from excellent to very poor (adjusted root mean square deviation between 0 and 19%). The maximum CSA error was found to be as high as 99%. We therefore recommend avoiding the algorithms approximating the RTT CSA using circle or ellipse models in studies where accurate estimation of the CSA is required.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».