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Enregistrement W2003582049 · doi:10.1088/0957-0233/21/12/125802

Bias and precision of algorithms in estimating the cross-sectional area of rat tail tendons

2010· article· en· W2003582049 sur OpenAlexaff
Gabriel Parent, Matthieu Cyr, Frédérique Desbiens-Blais, Ève Langelier

Notice bibliographique

RevueMeasurement Science and Technology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEllipseAlgorithmMean squared errorDegrees of freedom (physics and chemistry)MathematicsObservational errorComputer scienceGeometryPhysicsStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cross-section area (CSA) of rat tail tendons (RTTs), a common experimental model in biomechanics and mechanobiology, is often approximated using circle or ellipse models. This assumption may nevertheless be faulty given the sensitivity of the mechanical properties on CSA estimation. To investigate this issue, we designed a new optic micrometer to be used under a stereomicroscope. Images of specimen projections were captured at angular increments and specimen edges were localized within a local reference frame using an image analysis algorithm based on contrast. The cross-sectional areas estimated using four algorithms (single measurement circle, multiple measurement circle, two degrees of freedom ellipse, three degrees of freedom ellipse) were compared to those obtained using the best algorithm currently described in the literature: the profile reconstruction algorithm. We showed that the four tested algorithms exhibit moderate but uniform bias (mean systematic error between 7 and 11%) with very non-uniform precision, varying from excellent to very poor (adjusted root mean square deviation between 0 and 19%). The maximum CSA error was found to be as high as 99%. We therefore recommend avoiding the algorithms approximating the RTT CSA using circle or ellipse models in studies where accurate estimation of the CSA is required.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,200

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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