Genetic Variants of <b> <i>GPX1</i> </b> and <b> <i>SOD2</i> </b> and Breast Cancer Risk at the Ontario Site of the Breast Cancer Family Registry
Notice bibliographique
Résumé
There are several genes that code for enzymes, including various forms of superoxide dismutase and glutathione peroxidase, that protect the cell against oxidative damage that, in turn, can lead to carcinogenesis. There are a few common genetic polymorphisms in these genes that lead to altered proteins. Three that have been identified are SOD2 Val-9Ala, GPX1 Pro198Leu, and the GPX1 GCG repeat (three alleles with four, five, or six repeats). The SOD2 variant has been associated with increased breast cancer risk in two studies. The GPX1 variants have not been studied with respect to breast cancer, but Pro198Leu has been associated with lung cancer. We conducted a case-control study of these three polymorphisms in incident, invasive breast cancer in Caucasian women under 55. There were 399 cases and 372 controls genotyped, of whom 488 were premenopausal, 208 postmenopausal, and 75 of unknown menopausal status. We were unable to replicate the previously observed association with SOD2 Val-9Ala and also found no association between breast cancer and GPX1 Pro198Leu. However, the allele of GPX1 containing four GCG repeats was significantly associated with breast cancer risk in premenopausal women (odds ratio, 1.55; 95% confidence interval, 1.04-2.30 for carriers versus noncarriers). There is a significant trend of increasing risk with increasing number of alleles with four GCG repeats (P = 0.03). This variant has not previously been reported to be associated with breast cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».