Abstract 2001: GATA2: Potential role as a prostate cancer metastasis-driving gene
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Metastasis is thought to result from changes in the expression of specific metastasis-driving genes leading to a cascade of activated downstream genes that set the metastatic process in motion. The present study was aimed at identifying such metastasis-driving genes in prostate cancer for potential therapy and identification of primary prostate cancers that are likely to metastasize. To this end, a differential gene expression profile was established of metastatic LTL-313H and non-metastatic LTL-313B prostate cancer tissue xenografts, derived from one patient's specimen using sub-renal capsule grafting technology. The profile was then subjected to integrative analysis using the Ingenuity Upstream Regulator Analysis tool. Six candidate master regulatory genes were identified, including GATA2, a gene encoding a pioneer factor in prostate cancer. Elevated GATA2 expression in clinical metastatic prostate cancer tissues was found to correlate with poor patient prognosis. Furthermore, GATA2 gene silencing in human prostate cancer LNCaP cells led to a marked reduction in cell migration, tissue invasion, focal adhesion disassembly and to a drastic change in cell transcriptome. Furthermore, 582 genes were identified that are (i) differentially expressed after GATA2 gene silencing in LNCaP cells and (ii) whose changes in gene expression significantly correlated with changes in GATA2 expressions in a MSKCC prostate cancer patient cohort. Taken together, the data suggest that GATA2 could represent a prostate cancer metastasis-driving gene and that the expression patterns of GATA2 and its associated-genes could serve as signatures (biomarkers) for poor prognosis in prostate cancer. Citation Format: Yan Ting Chiang, Kendric Wang, Francesco Crea, Colin Collins, Peter Gout, Yuzhuo Wang. GATA2: Potential role as a prostate cancer metastasis-driving gene. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 2001. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-2001
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».