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Enregistrement W2003832582 · doi:10.1371/journal.pone.0049983

Specific Synthesis of Neurostatin and Gangliosides O-Acetylated in the Outer Sialic Acids Using a Sialate Transferase

2012· article· en· W2003832582 sur OpenAlexaff
Lorenzo Romero‐Ramírez, Isabel García‐Álvarez, Ramón Campos‐Olivas, Michel Gilbert, Marie-France Goneau, Alfonso Fernández‐Mayoralas, Manuel Nieto‐Sampedro

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesMinisterio de Ciencia e Innovación
Mots-clésSialic acidGangliosideAcetylationBiochemistrySialyltransferaseEnzymeChemistrySialidaseTransferaseGlycolipidAcetyltransferaseNeuraminidase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gangliosides are sialic acid containing glycosphingolipids, commonly found on the outer leaflet of the plasma membrane. O-acetylation of sialic acid hydroxyl groups is one of the most common modifications in gangliosides. Studies on the biological activity of O-acetylated gangliosides have been limited by their scarcity in nature. This comparatively small change in ganglioside structure causes major changes in their physiological properties. When the ganglioside GD1b was O-acetylated in the outer sialic acid, it became the potent inhibitor of astroblast and astrocytoma proliferation called Neurostatin. Although various chemical and enzymatic methods to O-acetylate commercial gangliosides have been described, O-acetylation was nonspecific and produced many side-products that reduced the yield. An enzyme with O-acetyltransferase activity (SOAT) has been previously cloned from the bacteria Campylobacter jejuni. This enzyme catalyzed the acetylation of oligosaccharide-bound sialic acid, with high specificity for terminal alpha-2,8-linked residues. Using this enzyme and commercial gangliosides as starting material, we have specifically O-acetylated the gangliosides' outer sialic acids, to produce the corresponding gangliosides specifically O-acetylated in the sialic acid bound in alpha-2,3 and alpha-2,8 residues. We demonstrate here that O-acetylation occurred specifically in the C-9 position of the sialic acid. In summary, we present a new method of specific O-acetylation of ganglioside sialic acids that permits the large scale preparation of these modified glycosphingolipids, facilitating both, the study of their mechanism of antitumoral action and their use as therapeutic drugs for treating glioblastoma multiform (GBM) patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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