Human interferon regulatory factor-1 gene and its promoter sequences revealed by population-based complete gene sequencing
Notice bibliographique
Résumé
Interferon regulatory factor-1 (IRF-1) plays important roles in host immunity, cell proliferation and apoptosis. The current GenBank sequence for human IRF-1 (accession number: L05072) was derived from a human placenta DNA library and reported in 1992. In one recent population-based sequence study, we observed consistent discrepancies between our IRF-1 sequence data and GenBank reference sequences suggesting that, current IRF-1 reference sequence was not representative for all populations. By complete gene sequencing, we obtained a representative full-length IRF-1 sequence from a single subject. Compared to submission L05072, our population-based data contains: 35 nucleotide additions, 8 nucleotide removals and another 12 nucleotide replacements. A single nucleotide difference was observed in the IRF-1 promoter sequence compared to GenBank sequence (X53095). These changes were confirmed in 350 Kenyans and 28 non-African donors. The accuracy of a reference sequence is crucial for downstream genetic and functional studies and this study provides more complete and accurate data on the sequence of the human IRF-1 gene and its immediate promoter region.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».