A Rapid Detection Method for the Ryanodine Receptor 1 (C7360G) Mutation in Quarter Horses
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Anesthetic-induced malignant hyperthermia has been documented in Quarter Horses and is caused by a single-point mutation in the ryanodine receptor 1 gene at nucleotide C7360G generating a R2454G amino acid substitution. An accurate, faster molecular test that is less prone to contamination would facilitate screening for the mutation in horses intended for breeding, in those undergoing surgical procedures, and in those with clinical signs compatible with malignant hyperthermia. OBJECTIVE: To report a rapid and accurate method for the detection of the ryanodine receptor 1 C7360G mutation. ANIMALS: Eleven diseased, 10 healthy, and 225 randomly selected Quarter Horses. METHODS: This study included horses with the ryanodine receptor 1 C7360G mutation as detected by gene sequencing. Available genomic and complementary DNA extracted from whole blood, hair or skeletal muscle was used for genetic analysis. Real-time polymerase chain reaction (RT-PCR) melting curve analysis was performed by equine specific primers and 2 hybridization probes (sensor and anchor probes) that contain the site of the mutation. Results from this method were blinded and compared with nucleic acid sequencing for validation. RESULTS: A rapid genotyping assay with fluorescence resonance energy transfer probes and melting curve analysis was accurate (100% agreement, K= 1) for identification of affected horses. The prevalence of the mutation in a random population of Quarter Horses was 1.3%. CONCLUSIONS AND CLINICAL IMPORTANCE: Malignant hyperthermia in Quarter Horses can be rapidly and accurately detected by RT-PCR melting curve genotyping with hybridization probes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».