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Enregistrement W2004130595 · doi:10.1094/phyto-95-0793

Molecular Epidemiology of White Pine Blister Rust: Recombination and Spatial Distribution

2005· article· en· W2004130595 sur OpenAlex
Richard C. Hamelin, Maura Allaire, Marie‐Josée Bergeron, Marie-Claude Nicole, Nicole Lecours

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueYeasts and Rust Fungi Studies
Établissements canadiensNatural Resources Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyBiological dispersalHaplotypeRecombinationStripe rustPloidySporeSpatial distributionGeneticsRust (programming language)Genetic diversityWhite (mutation)BotanyEvolutionary biologyGenotypePlant disease resistancePopulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Multilocus haplotypes (MLHs) were derived for the spermogonial (monokaryotic haploid) stage of Cronartium ribicola, the causal agent of white pine blister rust. Six random amplified polymorphic DNA loci and three single-strand conformational polymorphism markers were analyzed for 246 rust samples collected from two heavily infected white pine plantations. All cankers sampled were spatially located within the plantations. The hypothesis that spores are not locally disseminated was supported by the absence of any spatial clustering in the distribution of the MLHs. A large number of MLHs was found at both sites and the haplotypic diversity was close to the maximum (one) in both populations. All measures of recombination were not different from expectations under a scenario of sexual recombination. Genetic differentiation between the two sites was very low (theta = 0.023), yet it was significantly different from zero (P < 0.01). This analysis is in agreement with a scenario of extensive sexual recombination followed by some long-distance dispersal.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,260
Score d'incertitude au seuil0,429

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle