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Enregistrement W2004157397 · doi:10.1074/jbc.m102314200

Molecular Cloning of a Third Member of the Potassium-dependent Sodium-Calcium Exchanger Gene Family,NCKX3

2001· article· en· W2004157397 sur OpenAlexaff
Alexander Kraev, Beate D. Quednau, Stephen Leach, Xiaofang Li, Hui Dong, Robert J. Winkfein, Marco Perizzolo, Xinjiang Cai, RuoMei Yang, Kenneth D. Philipson, Jonathan Lytton

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteU.S. Public Health Service
Mots-clésSodium-calcium exchangerSolute carrier familyHeterologous expressionBiologyPeptide sequenceAmino acidGeneGene familyCloning (programming)Hippocampal formationTransporterMolecular biologyBiochemistryCell biologyGeneticsGene expressionNeuroscienceRecombinant DNAIntracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We describe here the identification and characterization of a novel member of the family of K(+)-dependent Na(+)/Ca(2+) exchangers, NCKX3 (gene SLC24A3). Human NCKX3 encodes a protein of 644 amino acids that displayed a high level of sequence identity to the other family members, rod NCKX1 and cone/neuronal NCKX2, in the hydrophobic regions surrounding the "alpha -repeat" sequences thought to form the ion-binding pocket for transport. Outside of these regions NCKX3 showed no significant identity to other known proteins. As anticipated from this sequence similarity, NCKX3 displayed K(+)-dependent Na(+)/Ca(2+) exchanger activity when assayed in heterologous expression systems, using digital imaging of fura-2 fluorescence, electrophysiology, or radioactive (45)Ca(2+) uptake. The N-terminal region of NCKX3, although not essential for expression, increased functional activity at least 10-fold and may represent a cleavable signal sequence. NCKX3 transcripts were most abundant in brain, with highest levels found in selected thalamic nuclei, in hippocampal CA1 neurons, and in layer IV of the cerebral cortex. Many other tissues also expressed NCKX3 at lower levels, especially aorta, uterus, and intestine, which are rich in smooth muscle. The discovery of NCKX3 thus expands the K(+)-dependent Na(+)/Ca(2+) exchanger family and suggests this class of transporter has a more widespread role in cellular Ca(2+) handling than previously appreciated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations157
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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