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Enregistrement W2004370382 · doi:10.1186/bcr1753

Characterization of a negative transcriptional element in the BRCA1 promoter

2007· article· en· W2004370382 sur OpenAlexaff
Gwen MacDonald, Melissa Stramwasser, Christopher R. Mueller

Notice bibliographique

RevueBreast Cancer Research · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRepressorPromoterResponse elementTranscription factorBiologyTranscription (linguistics)E2FGeneRegulation of gene expressionGeneticsMolecular biologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Decreased transcription of the BRCA1 gene has previously been observed to occur in sporadic breast tumours, making elucidation of the mechanisms regulating the expression of this gene important for our understanding of the etiology of the disease. METHODS: Transcriptional elements involved in the regulation of the BRCA1 promoter were analysed by co-transfection experiments into the human MCF-7 and T-47D breast cancer cell lines. RESULTS: We have identified a repressor element, referred to as the UP site, within the proximal BRCA1 promoter whose inactivation results in increased promoter activity. An E2F recognition element, previously suggested to mediate repression via E2F-6, is adjacent to the UP site and its inactivation also leads to increased BRCA1 expression. These two elements appear to form a composite repressor element whose combined effect is additive. The UP element is composed of two sequences, one of which binds the ubiquitously expressed ets family transcription factor GABP alpha/beta. This site is distinct from a previously identified GABP alpha/beta site, the RIBS element, though the RIBS site appears to be necessary for derepression of the promoter via mutations in the UP site. Knockdown of GABP alpha using an shRNA vector confirms that this protein is important for the function of both the RIBS and UP sites. CONCLUSION: The identification of a repressor element in the BRCA1 promoter brings a new level of complexity to the regulation of BRCA1 expression. The elements characterized here may play a normal role in the integration of a variety of signals, including two different growth related pathways, and it is possible that loss of the ability to derepress the BRCA1 promoter during critical periods may contribute to breast transformation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,556
Score d'incertitude au seuil0,199

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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