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Enregistrement W2004435014 · doi:10.1042/bj20070811

The N-terminal region of ABC50 interacts with eukaryotic initiation factor eIF2 and is a target for regulatory phosphorylation by CK2

2007· article· en· W2004435014 sur OpenAlexaff
Sònia Paytubi, Nicholas A. Morrice, Jérôme Boudeau, Christopher G. Proud

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-cléseIF2RibosomeBiologyEukaryotic initiation factorPhosphoproteinEukaryotic translationEukaryotic translation initiation factor 4 gammaInitiation factorCell biologyEIF4A1BiochemistryTranslation (biology)PhosphorylationRNAMessenger RNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABC50 is an ABC (ATP-binding cassette) protein which, unlike most ABC proteins, lacks membrane-spanning domains. ABC50 interacts with eIF2 (eukaryotic initiation factor 2), a protein that plays a key role in translation initiation and in its control, and in regulation of ribosomes. Here, we establish that the interaction of ABC50 with eIF2 involves features in the N-terminal domain of ABC50, the region of ABC50 that differs most markedly from other ABC proteins. This region also shows no apparent similarity to the eIF2-binding domains of other partners of eIF2. In contrast, the N-terminus of ABC50 cannot bind to ribosomes by itself, but it can in conjunction with one of the nucleotide-binding domains. We demonstrate that ABC50 is a phosphoprotein and is phosphorylated at two sites by CK2. These sites, Ser-109 and Ser-140, lie in the N-terminal part of ABC50 but are not required for the binding of ABC50 to eIF2. Expression of a mutant of ABC50 in which both sites are mutated to alanine markedly decreased the association of eIF2 with 80S ribosomal and polysomal fractions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,303

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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