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Enregistrement W2004500875 · doi:10.1371/journal.ppat.1002431

Role of Permissive Neuraminidase Mutations in Influenza A/Brisbane/59/2007-like (H1N1) Viruses

2011· article· en· W2004500875 sur OpenAlexafffund
Yacine Abed, Andrés Pizzorno, Xavier Bouhy, Guy Boivin

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensCentre hospitalier de l'Université LavalUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésNeuraminidaseMutantMicrobiologyChemistryBiologyVirologyInfectivityVirusMolecular biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neuraminidase (NA) mutations conferring resistance to NA inhibitors were believed to compromise influenza virus fitness. Unexpectedly, an oseltamivir-resistant A/Brisbane/59/2007 (Bris07)-like H1N1 H275Y NA variant emerged in 2007 and completely replaced the wild-type (WT) strain in 2008-2009. The NA of such variant contained additional NA changes (R222Q, V234M and D344N) that potentially counteracted the detrimental effect of the H275Y mutation on viral fitness. Here, we rescued a recombinant Bris07-like WT virus and 4 NA mutants/revertants (H275Y, H275Y/Q222R, H275Y/M234V and H275Y/N344D) and characterized them in vitro and in ferrets. A fluorometric-based NA assay was used to determine Vmax and Km values. Replicative capacities were evaluated by yield assays in ST6Gal1-MDCK cells. Recombinant NA proteins were expressed in 293T cells and surface NA activity was determined. Infectivity and contact transmission experiments were evaluated for the WT, H275Y and H275Y/Q222R recombinants in ferrets. The H275Y mutation did not significantly alter Km and Vmax values compared to WT. The H275Y/N344D mutant had a reduced affinity (Km of 50 vs 12 µM) whereas the H275Y/M234V mutant had a reduced activity (22 vs 28 U/sec). In contrast, the H275Y/Q222R mutant showed a significant decrease of both affinity (40 µM) and activity (7 U/sec). The WT, H275Y, H275Y/M234V and H275Y/N344D recombinants had comparable replicative capacities contrasting with H275Y/Q222R mutant whose viral titers were significantly reduced. All studied mutations reduced the cell surface NA activity compared to WT with the maximum reduction being obtained for the H275Y/Q222R mutant. Comparable infectivity and transmissibility were seen between the WT and the H275Y mutant in ferrets whereas the H275Y/Q222R mutant was associated with significantly lower lung viral titers. In conclusion, the Q222R reversion mutation compromised Bris07-like H1N1 virus in vitro and in vivo. Thus, the R222Q NA mutation present in the WT virus may have facilitated the emergence of NAI-resistant Bris07 variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,317
Score d'incertitude au seuil0,931

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,144
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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