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Enregistrement W2004542481 · doi:10.1677/jme.1.01602

Chromosomal localization of three somatostatin genes in zebrafish. Evidence that the [Pro2]-somatostatin-14 isoform and cortistatin are encoded by orthologous genes

2004· article· en· W2004542481 sur OpenAlexafffund
Hervé Tostivint, Lucille Joly, Isabelle Lihrmann, Marc Ekker, Hubert Vaudry

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Endocrinology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInstitut National de la Santé et de la Recherche Médicale
Mots-clésZebrafishDanioSyntenyGeneBiologyGeneticsSomatostatin receptor 3VertebrateGene isoformGenomeSomatostatinSomatostatin receptor 1Somatostatin receptor 2Somatostatin receptorEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is now evidence for the existence of two somatostatin genes in most vertebrate species, and even three somatostatin genes in teleosts. To help clarify the evolutionary relationships between the different somatostatin isoforms currently known, we characterized the somatostatin loci in a teleost species, the zebrafish Danio rerio, and compared them with the corresponding regions in the human and pufferfish genomes. The occurrence of three somatostatin genes, termed SS1, SS2 and SSII, has been previously demonstrated in the zebrafish. Radiation hybrid mapping assigned these three genes to linkage groups 15, 23 and 2, respectively. Conserved synteny of the zebrafish SS2 gene and the human cortistatin gene was revealed by comparative genomic analysis, indicating that mammalian cortistatin is orthologous to the SS2 variant of non-mammalian species. In contrast, using a similar approach, it was not possible to identify the evolutionary relationships between the atypical SSII gene of zebrafish and the other teleost SSII genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,727

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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