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Enregistrement W2004562353 · doi:10.1371/journal.pone.0117039

Comprehensive Evaluation of the Immune Risk Phenotype in Successfully Treated HIV-Infected Individuals

2015· article· en· W2004562353 sur OpenAlexafffund
Patricia Ndumbi, Louise Gilbert, Christos Tsoukas

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV-related health complications and treatments
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University Health CentreMcGill University
Mots-clésImmune systemCD8ImmunologyImmunosenescenceImmune dysregulationCD28SenescenceCD4-CD8 RatioCytotoxic T cellBiologyT cellPhenotypeViral loadMedicineVirologyVirusInternal medicineGeneticsLymphocyte subsetsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Despite successful treatment and CD4+ T-cell recovery, HIV-infected individuals often experience a profound immune dysregulation characterized by a persistently low CD4:CD8 T-cell ratio. This residual immune dysregulation is reminiscent of the Immune Risk Phenotype (IRP) previously associated with morbidity and mortality in the uninfected elderly (>85 years). The IRP consists of laboratory markers that include: a low CD4:CD8 T-cell ratio, an expansion of CD8+CD28- T-cells and cytomegalovirus (CMV) seropositivity. Despite the significant overlap in immunological phenotypes between normal aging and HIV infection, the IRP has never been evaluated in HIV-infected individuals. In this pilot study we characterized immune changes associated with the IRP in a sample of successfully treated HIV-infected subjects. METHODS: 18 virologically suppressed HIV-infected subjects were categorized into 2 groups based on their IRP status; HIV+IRP+, (n = 8) and HIV+IRP-, (n = 10) and compared to 15 age-matched HIV uninfected IRP negative controls. All individuals were assessed for functional and phenotypic immune characteristics including: pro-inflammatory cytokine production, antigen-specific proliferation capacity, replicative senescence, T-cell differentiation and lymphocyte telomere length. RESULTS: Compared to HIV-infected subjects without an IRP, HIV+IRP+ subjects exhibited a higher frequency of TNF-α-producing CD8+ T-cells (p = 0.05) and a reduced proportion of CD8+ naïve T-cells (p = 0.007). The IRP status was also associated with a marked up-regulation of the replicative senescence markers CD57 and KLGR1, on the surface of CD8+T-cells (p = 0.004). Finally, HIV+IRP+ individuals had a significantly shorter mean lymphocyte telomere length than their non-IRP counterparts (p = 0.03). CONCLUSIONS: Our findings suggest that, despite similar levels of treatment-mediated viral suppression, the phenotypic and functional immune characteristics of HIV+IRP+ individuals are distinct from those observed in non-IRP individuals. The IRP appears to identify a subset of treated HIV-infected individuals with a higher degree of immune senescence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,102
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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