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Enregistrement W2004588466 · doi:10.5588/ijtld.11.0614

Diagnostic accuracy of induced sputum LAM ELISA for tuberculosis diagnosis in sputum-scarce patients

2012· article· en· W2004588466 sur OpenAlexfundno aff
Jonny Peter, Tamaryn J. Cashmore, Richard Meldau, Grant Theron, Richard N. van Zyl-Smit, Keertan Dheda

Notice bibliographique

RevueThe International Journal of Tuberculosis and Lung Disease · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean and Developing Countries Clinical Trials PartnershipFogarty International CenterCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthMedical Research Council CanadaSouth African Medical Research CouncilNational Research FoundationEuropean Commission
Mots-clésMedicineLipoarabinomannanSputumTuberculosisMycobacterium tuberculosisInternal medicineReceiver operating characteristicSputum cultureGastroenterologyImmunologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To examine whether a lipoarabinomannan (LAM) enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) that offers diagnostic utility using urine in patients with tuberculosis (TB) and human immunodeficiency virus (HIV) co-infection can be used in induced sputum to diagnose sputum-scarce patients with suspected TB. DESIGN: LAM was measured in induced sputum samples obtained from 61 consecutively recruited sputum-scarce TB suspects in a tertiary hospital respiratory clinic in South Africa. Liquid culture positivity for Mycobacterium tuberculosis was used as the reference standard. Receiver operating characteristic analysis was used to assess alternative LAM concentration cut-offs. RESULTS: A total of 87% (53/61) of study patients had a valid M. tuberculosis culture result; 49% (23/53) were HIV-infected and 17% (9/53) were culture-positive for M. tuberculosis. Induced sputum smear microscopy and LAM ELISA had an overall sensitivity of 56% (95%CI 27-81); however, the specificity of LAM ELISA was 48% (95%CI 34-62), while the positive and negative predictive values were respectively 18% (95%CI 8-36) and 84% (95%CI 65-94). An optimal rule-in cut-off selected by receiver operating characteristic (LAM concentration >5.73 ng/ml) increased test specificity to 98% and reduced sensitivity to 22%. Normalisation of the assay for sample total protein or cell count did not improve diagnostic accuracy. CONCLUSIONS: In this proof-of-concept study, the ELISA was not clinically useful for TB diagnosis using induced sputum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,030
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,030
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,319 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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