Rumen epithelial adaptation to high-grain diets involves the coordinated regulation of genes involved in cholesterol homeostasis
Notice bibliographique
Résumé
The molecular mechanisms underlying rumen epithelial adaption to high-grain (HG) diets are unknown. To gain insight into the metabolic mechanisms governing epithelial adaptation, mature nonlactating dairy cattle (n = 4) were transitioned from a high-forage diet (HF, 0% grain) to an HG diet (65% grain). After the cattle were fed the HG diet for 3 wk, they returned to the original HF diet, which they were fed for an additional 3 wk. Continuous ruminal pH, ruminal short chain fatty acids, and plasma β-hydroxybutyrate were measured on a weekly basis, and rumen papillae were biopsied from the ventral sac to assess alterations in mRNA expression profiles. The subacute form of ruminal acidosis was diagnosed during the first week of the HG period (4.6 ± 1.6 h/day <pH 5.6), but not during weeks 2 and 3, thereby indicating ruminal adaption to the HG diet. Changes in the mRNA expression profile of rumen papillae were initially examined using Bovine Affymetrix microarrays; a total of 521 differentially expressed genes (false discovery rate P < 0.08) were uncovered from the first to third week of the HG period. Ingenuity Pathway Analysis of microarray results revealed that enzymes involved in cholesterol synthesis were coordinately downregulated from the first to third week of the HG period. In addition, the LXR/RXR activation pathway was significant and included several genes involved in intracellular cholesterol homeostasis. The differential expression signature of eight genes representing the key regulatory points of cholesterol homeostasis was confirmed by quantitative real-time PCR. Based upon our pathway and network results we propose a model to explain cellular events during rumen epithelial adaptation to HG diets and thus provide molecular targets that may be useful in the treatment and prevention of ruminal acidosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».