Development of an HTS Assay for Na <sup>+</sup> , K <sup>+</sup> -ATPase Using Nonradioactive Rubidium Ion Uptake
Notice bibliographique
Résumé
A high-throughput screening (HTS) assay was developed for the Na(+),K(+)-ATPase channel in order to study rubidium uptake as a measure of the functional activity and modulation of this exchanger. The assay uses elemental rubidium as a tracer for K(+) ions. Three cell lines were used to study the exchanger, and the assay was performed in a 96-well microtiter plate format. Rb(+) uptake was carried by the CHO-K1 cells at 37 degrees C; the maximum ion influx was at 80 min of incubation of the cell line in the medium containing 5.4 mM RbCl. The cells were incubated in Rb(+) uptake buffer (5.4 mM) and with the pump blocker ouabain for 1, 2, and 3 h, respectively. A complete block of the Rb(+) uptake was observed with a 5 mM concentration of ouabain for all the three time intervals. The ouabain 50% inhibitory concentration (IC(50)) value for CHO-K1 cell line ATPase was observed to be 298 microM after 3 h of incubation. In addition, IC(50) values of 94 and 89 microM were observed at 30 min of incubation, indicating that the protocol shows reproducible results. A Z' factor higher than 0.7 was observed in the assays. These studies extend the profile of Na(+),K(+)-ATPases and demonstrate the feasibility of this HTS assay system to screen for compounds that pharmacologically modulate the function of Na(+),K(+)-ATPase.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».