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Enregistrement W2004642591 · doi:10.1089/adt.2004.2.535

Development of an HTS Assay for Na <sup>+</sup> , K <sup>+</sup> -ATPase Using Nonradioactive Rubidium Ion Uptake

2004· article· en· W2004642591 sur OpenAlexaff
Sikander Gill, Rajwant K. Gill, David Wicks, Sasko Despotovski, Liang Dong

Notice bibliographique

RevueAssay and Drug Development Technologies · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensAurora College
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRubidiumChemistryIonRadiochemistryATPasePotassiumBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A high-throughput screening (HTS) assay was developed for the Na(+),K(+)-ATPase channel in order to study rubidium uptake as a measure of the functional activity and modulation of this exchanger. The assay uses elemental rubidium as a tracer for K(+) ions. Three cell lines were used to study the exchanger, and the assay was performed in a 96-well microtiter plate format. Rb(+) uptake was carried by the CHO-K1 cells at 37 degrees C; the maximum ion influx was at 80 min of incubation of the cell line in the medium containing 5.4 mM RbCl. The cells were incubated in Rb(+) uptake buffer (5.4 mM) and with the pump blocker ouabain for 1, 2, and 3 h, respectively. A complete block of the Rb(+) uptake was observed with a 5 mM concentration of ouabain for all the three time intervals. The ouabain 50% inhibitory concentration (IC(50)) value for CHO-K1 cell line ATPase was observed to be 298 microM after 3 h of incubation. In addition, IC(50) values of 94 and 89 microM were observed at 30 min of incubation, indicating that the protocol shows reproducible results. A Z' factor higher than 0.7 was observed in the assays. These studies extend the profile of Na(+),K(+)-ATPases and demonstrate the feasibility of this HTS assay system to screen for compounds that pharmacologically modulate the function of Na(+),K(+)-ATPase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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