Identification and Characterization of NeuB3 from Campylobacter jejuni as a Pseudaminic Acid Synthase
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Campylobacter jejuni and Campylobacter coli are the main causes of bacterial diarrhea worldwide, and Helicobacter pylori is known to cause duodenal ulcers. In all of these pathogenic organisms, the flagellin proteins are heavily glycosylated with a 2-keto-3-deoxy acid, pseudaminic acid (5,7-diacetamido-3,5,7,9-tetradeoxy-L-glycero-L-manno-nonulosonic acid). The presence of pseudaminic acid is required for the proper development of the flagella and is thereby necessary for motility in, and invasion of, the host. In this study we report the first characterization of NeuB3 from C. jejuni as a pseudaminic acid synthase; the enzyme directly responsible for the biosynthesis of pseudaminic acid. Pseudaminic acid synthase catalyzes the condensation of phosphoenolpyruvate (PEP) with the hexose, 2,4-diacetamido-2,4,6-trideoxy-L-altrose (6-deoxy-AltdiNAc), to form pseudaminic acid and phosphate. The enzymatic activity was monitored using 1H and 31P NMR spectroscopy, and the product was isolated and characterized. Kinetic analysis reveals that pseudaminic acid synthase requires the presence of a divalent metal ion for catalysis and that optimal catalysis occurs at pH 7.0. A coupled enzymatic assay gave the values for k(cat) of 0.65 +/- 0.01 s(-1), K(m)PEP of 6.5 +/- 0.4 microM, and K(m)6-deoxy-AltdiNAc of 9.5 +/- 0.7 microM. A mechanistic study on pseudaminic acid synthase, using [2-18O]PEP, shows that catalysis proceeds through a C-O bond cleavage mechanism similar to other PEP condensing synthases such as sialic acid synthase.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle