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Enregistrement W2004683819 · doi:10.1089/omi.2012.0119

“OMICS” of Human Sperm: Profiling Protein Phosphatases

2013· article· en· W2004683819 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueOMICS A Journal of Integrative Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSperm and Testicular Function
Établissements canadiensKinexus Bioinformatics Corporation (Canada)University of British Columbia
Organismes subventionnairesFundação para a Ciência e a TecnologiaUniversidade de Aveiro
Mots-clésProfiling (computer programming)BiologyComputational biologyPhosphataseSpermData scienceBioinformaticsGeneticsComputer sciencePhosphorylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphorylation is a major regulatory mechanism in eukaryotic cells performed by the concerted actions of kinases and phosphatases (PPs). Protein phosphorylation has long been relevant to sperm physiology, from acquisition of motility in the epididymis to capacitation in the female reproductive tract. While the precise kinases involved in the regulation of sperm phosphorylation have been studied for decades, the PPs have only recently received research interest. Tyrosine phosphorylation was first implicated in the regulation of several sperm-related functions, from capacitation to oocyte binding. Only afterwards, in 1996, the inhibition of the serine/threonine-PP phosphoprotein phosphatase 1 (PPP1) by okadaic acid and calyculin-A was shown to initiate motility in caput epididymal sperm. Today, the current mechanisms of sperm motility acquisition based on PPP1 and its regulators are still far from being fully understood. PPP1CC2, specifically expressed in mammalian sperm, has been considered to be the only sperm-specific serine/threonine-PP, while other PPP1 isoforms were thought to be absent from sperm. This article examines the "Omics" of human sperm, and reports, for the first time, the identification of three new serine/threonine-protein PPs, PPP1CB, PPP4C, and PPP6C, in human sperm, together with two tyrosine-PPs, MKP1 and PTP1C. We specifically localized in sperm PPP1CB and PPP1CC2 from the PPP1 subfamily, and PPP2CA, PPP4C, and PPP6C from the PPP2 subfamily of the serine/threonine-PPs. A semi-quantitative analysis was performed to determine the various PPs' differential expression in sperm head and tail. These findings contribute to a comprehensive understanding of human sperm PPs, and warrant further research for their clinical and therapeutic significance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,309

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle