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Enregistrement W2004689193 · doi:10.1128/aac.01440-05

First Occurrence of a <i>Pseudomonas aeruginosa</i> Isolate in the United States Producing an IMP Metallo-β-Lactamase, IMP-18

2006· letter· en· W2004689193 sur OpenAlexaboutno aff
Nancy D. Hanson, Ashfaque Hossain, Larry L. Buck, Ellen Smith Moland, Kenneth S. Thomson

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2006
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPseudomonas aeruginosaMicrobiologyPseudomonadalesPseudomonadaceaeBiologyChemistryBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

First Occurrence of a Pseudomonas aeruginosa Isolate in the United StatesProducing an IMP Metallo-␤-Lactamase, IMP-18Metallo-␤-lactamases hydrolyze most ␤-lactam antibiotics except aztreonam.Therefore, many pathogens that produce these enzymes at high levels are resistant to the majority of ␤-lactam antibiotics, including the carbapenems.The first report of an imported metallo-␤-lactamase described a Pseudomonas aeruginosa isolate obtained from a Japanese patient in 1988 (6).Since then, the occurrence of mobile genetic elements encoding metallo-␤-lactamases has extended beyond P. aeruginosa to include many types of gram-negative organisms distributed throughout the world (5).Areas which have reported these types of isolates include several countries in Asia and Europe; the Americas, including Brazil, Canada, and the United States; and Australia (5).Based on recent reports, there are two major families of imported metallo-␤-lactamases, IMP and VIM, that are carried on mobile gene cassettes inserted into integrons (5).Including those in this report, there are 18 variants of IMP metallo-␤-lactamases and 11 variants of VIM metallo-␤-lactamases (5).The only two published reports on metallo-␤-lactamases from the United States identified VIM-2 and VIM-7 (1, 4).In this study, we investigated a carbapenem-resistant P. aeruginosa isolate for metallo-␤-lactamase production.The isolate was recovered from the tracheal aspirate of a motorcycle accident victim in the southwestern United States.It was found to produce a new member of the IMP family of metallo-␤-lactamases.The isolate was identified by the Phoenix system (BD Diagnostic Systems, Sparks, Md.).Antibiotic susceptibility was determined by broth microdilution and interpreted by using CLSI criteria (2).These data are presented in Table 1.Metallo-␤lactamase production was phenotypically investigated by using the Etest metallo-␤-lactamase strip (AB BIODISK, Solna, Sweden).By Etest there was a Ն32-fold reduction in the MIC of imipenem in the presence of EDTA (Ն256 to 8 g/ml).The bla IMP-1-like gene was detected by PCR as previously described (3), using IMP-1-family-specific primers internal to the gene.Amplification of the full-length product of 781 bp was obtained by PCR, using an annealing temperature of 42°C, a magnesium concentration of 2 mM, and primers which flanked the gene.The forward primer was 5Ј-GTTAGAAAA GGAAAAGTATG-3Ј, and the reverse primer was 5Ј-TGCT GCAACGACTTGTTAG-3Ј.PCR products were generated on at least two separate occasions and sequenced by automated cycle sequencing, using an ABI Prism 3100-Avant Genetic analyzer.Sequence alignments and analyses were performed online using the BLAST program (www.ncbi.nlm.nih.gov).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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