The effect of <i>K‐</i> fluorescence reabsorption of selenium on the performance of an imaging detector for protein crystallography
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Protein crystallography is an important technique in the determination of three dimensional atomic structures of proteins. In order to reconstruct the atomic structure of protein from experimental diffraction data, both the magnitude and phase of the atomic scattering factor should be known. The phase can be calculated using the Multiple Wavelength Anomalous Dispersion (MAD) method. Selenium (Se) is commonly used as an anomalous scatterer in the MAD method since the K ‐edge of Se (12.6 keV) is readily accessible on most synchrotron X‐ray sources. Recently, we proposed a novel direct X‐ray conversion imager for protein crystallography which employs amorphous Se for the X‐ray to charge conversion and an amorphous silicon flat panel thin film transistor array as the charge image readout method. For the protein crystallography X‐ray energy range (6‐20 keV), X‐ray interaction in Se is due to the photoelectric effect. Therefore there is a possibility of generation and reabsorption of K ‐fluorescence at or above the K ‐edge. The reabsorption of a fraction of the generated K ‐fluorescence is a random process which leads to fluctuations in conversion gain and hence addition of image noise. In this paper, the physics of K ‐fluorescence is explained and the probability of K ‐fluorescence reabsorption of Se for the useful X‐ray energy of protein crystallography is calculated. Finally, the possible consequences from K ‐fluorescence reabsorption of Se on the performance of a protein crystallography imager where Se is used both as an anomalous scatterer and a photoconductor is elucidated. (© 2009 WILEY‐VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».