Blocking ER export of the Golgi SNARE SYP31 affects plant growth
Notice bibliographique
Résumé
We recently identified a novel and transplantable di-acidic motif (EXXD) that facilitates ER export of the Golgi syntaxin SYP31 (type IV protein) and which may function also for type I and type II proteins in plants. By mutagenesis of Arabidopsis thaliana SYP31 and live cell imaging experiments in tobacco leaf epidermal cells, we determined that replacing the MELAD sequence of SYP31 with gagag retained SYP31 in the ER, which demonstrates that the di-acidic motif ELAD is critical for SYP31 ER export. To investigate whether blockage of a Golgi SNARE in the ER have consequences for plant growth, we produced tobacco plants stably overexpressing either the wild type MELAD or the mutant gagag form of SYP31. Whereas tobacco plants overexpressing the wild-type SYP31 developed to set seed, tobacco plants overexpressing the mutant form gagag rapidly became chlorotic, ceased their growth and invariably died after several weeks. This indicated that retention of overexpressed SYP31 in the ER is likely toxic for the secretory pathway and, therefore, plant development. Putative explanations for this observation are discussed taking into account SNARE properties and possible interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».