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Enregistrement W2004933593 · doi:10.1074/jbc.m600015200

Identification of Key Functional Domains in the C Terminus of the K+-Cl– Cotransporters

2006· article· en· W2004933593 sur OpenAlexaff
Marc J. Bergeron, Édith Gagnon, Luc Caron, Paul Isenring

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensUniversité LavalHôtel-Dieu de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAllosteric regulationXenopusGene isoformMutantPhosphorylationCotransporterChemistryBiochemistryCell biologyBiologyEffectorSymporterBiophysicsTransporterGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The K+-Cl- cotransporter (KCC) isoforms constitute a functionally heterogeneous group of ion carriers. Emerging evidence suggests that the C terminus (Ct) of these proteins is important in conveying isoform-specific traits and that it may harbor interacting sites for 4beta-phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA)-induced effectors. In this study, we have generated KCC2-KCC4 chimeras to identify key functional domains in the Ct of these carriers and single point mutations to determine whether canonical protein kinase C sites underlie KCC2-specific behaviors. Functional characterization of wild-type (wt) and mutant carriers in Xenopus laevis oocytes showed for the first time that the KCCs do not exhibit similar sensitivities to changes in osmolality and that this distinguishing feature as well as differences in transport activity under both hypotonic and isotonic conditions are in part determined by the residue composition of the distal Ct. At the same time, several mutations in this domain and in the proximal Ct of the KCCs were found to generate allosteric-like effects, suggesting that the regions analyzed are important in defining conformational ensembles and that isoform-specific structural configurations could thus account for variant functional traits as well. Characterization of the other mutants in this work showed that KCC2 is not inhibited by PMA through phosphorylation of its canonical protein kinase C sites. Intriguingly, however, the substitutions N728S and S940A were seen to alter the PMA effect paradoxically, suggesting again that allosteric changes in the Ct are important determinants of transport activity and, furthermore, that the structural configuration of this domain can convey specific functional traits by defining the accessibility of cotransporter sites to regulatory intermediates such as PMA-induced effectors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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