Three Arabidopsis Fatty Acyl-Coenzyme A Reductases, FAR1, FAR4, and FAR5, Generate Primary Fatty Alcohols Associated with Suberin Deposition
Notice bibliographique
Résumé
Suberin is a protective hydrophobic barrier consisting of phenolics, glycerol, and a variety of fatty acid derivatives, including C18:0-C22:0 primary fatty alcohols. An eight-member gene family encoding alcohol-forming fatty acyl-coenzyme A reductases (FARs) has been identified in Arabidopsis (Arabidopsis thaliana). Promoter-driven expression of the beta-glucuronidase reporter gene indicated that three of these genes, FAR1(At5g22500), FAR4(At3g44540), and FAR5(At3g44550), are expressed in root endodermal cells. The three genes were transcriptionally induced by wounding and salt stress. These patterns of gene expression coincide with known sites of suberin deposition. We then characterized a set of mutants with T-DNA insertions in FAR1, FAR4, or FAR5 and found that the suberin compositions of roots and seed coats were modified in each far mutant. Specifically, C18:0-OH was reduced in far5-1, C20:0-OH was reduced in far4-1, and C22:0-OH was reduced in far1-1. We also analyzed the composition of polymer-bound lipids of leaves before and after wounding and found that the basal levels of C18:0-C22:0 primary alcohols in wild-type leaves were increased by wounding. In contrast, C18:0-OH and C22:0-OH were not increased by wounding in far5-1 and far1-1 mutants, respectively. Heterologous expression of FAR1, FAR4, and FAR5 in yeast confirmed that they are indeed active alcohol-forming FARs with distinct, but overlapping, chain length specificities ranging from C18:0 to C24:0. Altogether, these results indicate that Arabidopsis FAR1, FAR4, and FAR5 generate the fatty alcohols found in root, seed coat, and wound-induced leaf tissue.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».