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Enregistrement W2005020318 · doi:10.1074/jbc.m109.036772

A Novel Family of Apicomplexan Glideosome-associated Proteins with an Inner Membrane-anchoring Role

2009· article· en· W2005020318 sur OpenAlexaff
Hayley E. Bullen, Christopher J. Tonkin, Rebecca A. O’Donnell, Wai‐Hong Tham, Anthony T. Papenfuss, Sven B. Gould, Alan F. Cowman, Brendan S. Crabb, Paul R. Gilson

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueToxoplasma gondii Research Studies
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesWellcome TrustHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésBiologyApicomplexaGliding motilityCell biologyActinMyosinCytoskeletonTransmembrane proteinMotor proteinIntracellularBacterial adhesinIntracellular parasiteMotilityBiochemistryMicrotubulePlasmodium falciparumReceptorCellVirulenceGeneImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The phylum Apicomplexa are a group of obligate intracellular parasites responsible for a wide range of important diseases. Central to the lifecycle of these unicellular parasites is their ability to migrate through animal tissue and invade target host cells. Apicomplexan movement is generated by a unique system of gliding motility in which substrate adhesins and invasion-related proteins are pulled across the plasma membrane by an underlying actin-myosin motor. The myosins of this motor are inserted into a dual membrane layer called the inner membrane complex (IMC) that is sandwiched between the plasma membrane and an underlying cytoskeletal basket. Central to our understanding of gliding motility is the characterization of proteins residing within the IMC, but to date only a few proteins are known. We report here a novel family of six-pass transmembrane proteins, termed the GAPM family, which are highly conserved and specific to Apicomplexa. In Plasmodium falciparum and Toxoplasma gondii the GAPMs localize to the IMC where they form highly SDS-resistant oligomeric complexes. The GAPMs co-purify with the cytoskeletal alveolin proteins and also to some degree with the actin-myosin motor itself. Hence, these proteins are strong candidates for an IMC-anchoring role, either directly or indirectly tethering the motor to the cytoskeleton.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations128
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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