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Enregistrement W2005043203 · doi:10.1007/s12161-009-9090-3

Soybean Allergens Affecting North American Patients Identified by 2D Gels and Mass Spectrometry

2009· article· en· W2005043203 sur OpenAlexafffund
Christine Gagnon, Vaino Poysa, Elroy R. Cober, S. Gleddie

Notice bibliographique

RevueFood Analytical Methods · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFood Allergy and Anaphylaxis Research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaDirectorate for Biological Sciences
Mots-clésAllergenBlotWestern blotSoybean ProteinsStorage proteinChemistryProteomeImmunoglobulin ETandem mass spectrometryMass spectrometryTwo-dimensional gel electrophoresisGel electrophoresisProteomicsAllergyBiochemistryAntibodyBiologyImmunologySoy proteinChromatographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study, we compared the immunoglobulin E immunological reactions of 23 soy-allergic, nine soy-sensitive, and four non-allergic human sera to soybean proteins separated by 1D and 2D gel electrophoresis and screened by Western blot. This method led to novel allergen identification in soybean proteins by tandem mass spectrometry analysis of reactive proteins. Soybean is one of the eight most significant foods which provoke allergic reactions among North Americans. Previous studies have identified several putative allergens present in soybean seeds; however, many of these reports did not employ mass spectrometry to conclusively identify the allergenic proteins. Reviews have suggested that soybean seeds may contain between 10 and 20 different proteins responsible for provoking allergic reactions among sensitive patients. We report, in this study of North American patients, a total of 19 potentially allergenic proteins including ten identified by mass spectrometry and five novel allergens. We have also made extensive use of soybean lines lacking various subunits of the major seed storage proteins, glycinin and β-conglycinin. By using these knockout lines in Western blots with patient serum, it was conclusively demonstrated that some patients react predominantly to only a few proteins, while most react to four to six proteins. The findings herein describe the main allergic proteins present in soybean seeds, the relative significance of these allergens among North Americans, and some genetic lines of soybean lacking individual allergens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,342 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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