Overlapping and non-redundant functions of the <i>Arabidopsis</i> auxin response factors <i>MONOPTEROS</i> and <i>NONPHOTOTROPIC HYPOCOTYL 4</i>
Notice bibliographique
Résumé
Transcription factors of the auxin response factor (ARF) family have been implicated in auxin-dependent gene regulation, but little is known about the functions of individual ARFs in plants. Here, interaction assays, expression studies and combinations of multiple loss- and gain-of-function mutants were used to assess the roles of two ARFs, NONPHOTOTROPIC HYPOCOTYL 4 (NPH4/ARF7) and MONOPTEROS (MP/ARF5), in Arabidopsis development. Both MP and NPH4 interact strongly and selectively with themselves and with each other, and are expressed in vastly overlapping domains. We show that the regulatory properties of both genes are far more related than suggested by their single mutant phenotypes. NPH4 and MP are capable of controlling both axis formation in the embryo and auxin-dependent cell expansion. Interaction of MP and NPH4 in Arabidopsis plants is indicated by their joint requirement in a number of auxin responses and by synergistic effects associated with the co-overexpression of both genes. Finally, we demonstrate antagonistic interaction between ARF and Aux/IAA gene functions in Arabidopsis development. Overexpression of MP suppresses numerous defects associated with a gain-of-function mutation in BODENLOS (BDL)/IAA12. Together these results provide evidence for the biological relevance of ARF-ARF and ARF-Aux/IAA interaction in Arabidopsis plants and demonstrate that an individual ARF can act in both invariantly programmed pattern formation as well as in conditional responses to external signals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».