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Enregistrement W2005196978 · doi:10.1128/aem.03947-12

Bioengineering of Bacterial Polymer Inclusions Catalyzing the Synthesis of <i>N</i> -Acetylneuraminic Acid

2013· article· en· W2005196978 sur OpenAlexfundno aff
David O. Hooks, Paul Blatchford, Bernd H. A. Rehm

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPublic Health Agency of Canada
Mots-clésAldolase AChemistryEnzymeEscherichia coliSubstrate (aquarium)EpimerN-Acetylneuraminic acidBiochemistryStereochemistrySialic acidBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

N-Acetylneuraminic acid is produced by alkaline epimerization of N-acetylglucosamine to N-acetylmannosamine and then subsequent condensation with pyruvate catalyzed by free N-acetylneuraminic acid aldolase. The high-alkaline conditions of this process result in the degradation of reactants and products, while the purification of free enzymes to be used for the synthesis reaction is a costly process. The use of N-acetylglucosamine 2-epimerase has been seen as an alternative to the alkaline epimerization process. In this study, these two enzymes involved in N-acetylneuraminic acid production were immobilized to biopolyester beads in vivo in a one-step, cost-efficient process of production and isolation. Beads with epimerase-only, aldolase-only, and combined epimerase/aldolase activity were recombinantly produced in Escherichia coli. The enzymatic activities were 32 U, 590 U, and 2.2 U/420 U per gram dry bead weight, respectively. Individual beads could convert 18% and 77% of initial GlcNAc and ManNAc, respectively, at high substrate concentrations and near-neutral pH, demonstrating the application of this biobead technology to fine-chemical synthesis. Beads establishing the entire N-acetylneuraminic acid synthesis pathway were able to convert up to 22% of the initial N-acetylglucosamine after a 50-h reaction time into N-acetylneuraminic acid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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