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Enregistrement W2005197587 · doi:10.1089/omi.2006.10.444

Genome Wide Gene Expression Studies in Mood Disorders

2006· review· en· W2005197587 sur OpenAlexafffund
Adolfo Sequeira, Gustavo Turecki

Notice bibliographique

RevueOMICS A Journal of Integrative Biology · 2006
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene expression and cancer classification
Établissements canadiensDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesMcGill University
Mots-clésBipolar disorderMood disordersSchizophrenia (object-oriented programming)MicroarrayMoodDepression (economics)PhenotypeConfoundingGeneBiologyBioinformaticsPsychiatryGeneticsPsychologyMedicineGene expressionAnxietyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microarrays offer the possibility of screening in parallel virtually all genes expressed in a given tissue or to study the molecular signature associated with available treatments. As such, this technology has been increasingly used to investigate multifactorial and polygenic complex traits such as psychiatric disorders, in particular, schizophrenia and mood disorders. This review focuses on microarray studies investigating mood disorders. Study designs, methodologic approaches and limitations, subsequent follow-up strategies, and confirmation of results are discussed. Despite the apparent disparate and not always concordant results, it appears evident that this technology is a powerful and inevitable approach for the study of mood disorders, especially when phenotype-specific confounders are properly accounted for. Thus, alterations of mitochondrial, oligodendrocyte, and myelin related genes in bipolar disorder, of signaling and olidendroglial related genes in depression, and of GABA-glutamate related genes in depression and suicide have been observed and have confirmed new avenues for the study and the treatment of these complex disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,369
Écart entre enseignants0,325 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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