Notice bibliographique
Résumé
Epidemiology Improvements in two very different methods of investigation led to better understanding of the dynamics of a tuberculosis (TB) outbreak in British Columbia, Canada. A 10-fold increase in TB cases was reported in a Canadian community between 2006 and 2008. Initial genotyping analysis by Gardy et al. suggested that the outbreak was clonal; however, whole-genome sequencing of M. tuberculosis isolates produced a different picture: The cases were the result of two outbreaks. Examination of historical isolates indicated that the two lineages were present before the recent outbreak, which suggested that it was a social or environmental effect, not a genetic mutation, which triggered the increase in cases. Social network analysis was then used to build a picture of risk behavior, interactions, and social meeting places. When this was combined with the whole-genome data, the investigators were able to identify sources of the outbreak and a likely contribution of increased crack cocaine use. As sequencing costs go down and network analyses become more sophisticated, it is likely that these strategies will be increasingly used in public health efforts. N. Engl. J. Med. 364 , 730 (2011).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».