MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2005210820 · doi:10.4155/fmc.11.65

Electron-Density Descriptors as Predictors in Quantitative Structure–Activity/Property Relationships and Drug Design

2011· review· en· W2005210820 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFuture Medicinal Chemistry · 2011
Typereview
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensMount Saint Vincent UniversityDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAtoms in moleculesElectron densityChemistryMoleculeComputational chemistryChemical physicsProperty (philosophy)Atom (system on chip)Similarity (geometry)Resolution (logic)TransferabilityDensity functional theoryElectronPhysicsEpistemologyQuantum mechanicsComputer scienceOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The use of electron density-based molecular descriptors in drug research, particularly in quantitative structure--activity relationships/quantitative structure--property relationships studies, is reviewed. The exposition starts by a discussion of molecular similarity and transferability in terms of the underlying electron density, which leads to a qualitative introduction to the quantum theory of atoms in molecules (QTAIM). The starting point of QTAIM is the topological analysis of the molecular electron-density distributions to extract atomic and bond properties that characterize every atom and bond in the molecule. These atomic and bond properties have considerable potential as bases for the construction of robust quantitative structure--activity/property relationships models as shown by selected examples in this review. QTAIM is applicable to the electron density calculated from quantum-chemical calculations and/or that obtained from ultra-high resolution x-ray diffraction experiments followed by nonspherical refinement. Atomic and bond properties are introduced followed by examples of application of each of these two families of descriptors. The review ends with a study whereby the molecular electrostatic potential, uniquely determined by the density, is used in conjunction with atomic properties to elucidate the reasons for the biological similarity of bioisosteres.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,951
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle