Catalytic Mechanism of Chlamydia trachomatis Flavin-dependent Thymidylate Synthase
Notice bibliographique
Résumé
Here we report on a Chlamydia trachomatis gene that complements the growth defect of a thymidylate synthase-deficient strain of Escherichia coli. The complementing gene encodes a 60.9-kDa protein that shows low level primary sequence homology to a new class of thymidylate-synthesizing enzymes, termed flavin-dependent thymidylate synthases (FDTS). Purified recombinant chlamydial FDTS (CTThyX) contains bound flavin. Results with site-directed mutants indicate that highly conserved arginine residues are required for flavin binding. Kinetic characterization indicates that CTThyX is active as a tetramer with NADPH, methylenetetrahydrofolate, and dUMP required as substrates, serving as source of reducing equivalents, methyl donor, and methyl acceptor, respectively. dTMP and H(4)folate are products of the reaction. Production of H(4)folate rather than H(2)folate, as in the classical thymidylate synthase reaction, eliminates the need for dihydrofolate reductase, explaining the trimethoprim-resistant phenotype displayed by thyA(-) E. coli-expressing CTThyX. In contrast to the extensively characterized thyA-encoded thymidylate synthases, which form a ternary complex with substrates dUMP and CH(2)H(4)folate and follow an ordered sequential mechanism, CTThyX follows a ping-pong kinetic mechanism involving a methyl enzyme intermediate. Mass spectrometry was used to localize the methyl group to a highly conserved arginine, and site-directed mutagenesis showed this arginine to be critical for thymidylate synthesizing activity. These differentiating characteristics clearly distinguish FDTS from ThyA, making this class of enzymes attractive targets for rational drug design.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».