An NMR Metabolomics Study of Elk Inoculated with Chronic Wasting Disease
Notice bibliographique
Résumé
Chronic wasting disease (CWD) is a fatal neurodegenerative disease affecting both farmed and wild cervids, specifically deer and elk, and is a member of the larger family of prion diseases. Prion disease transmission is believed to occur through exposure to infectious prion material-a misfolded and infectious form of the prion protein that is normally present in the host. Chronic wasting disease is endemic to regions of central North America and infectious material can persist for long periods in the environment, posing challenges for remediation and monitoring. The current methods of detection are relatively invasive, require the host animal to be in intermediate to late stages of disease incubation, and are not without risk to those collecting samples. The potential for a blood test that could identify key biomarkers of disease incubation is of great interest. Serum from elk (Cervus elaphus) (n = 4) was collected on a monthly schedule before, and following, oral inoculation of CWD-positive homogenate, and collection continued until clinical signs were apparent. Blood was collected on the same schedule for a group of control animals (n = 2) housed under identical conditions. Targeted profiling, using (1)H-nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy, of serum metabolites was used to yield metabolite identification as well as quantitation. Hierarchical multivariate statistical orthogonal partial least-squares (O-PLS) models were generated to identify predictive components in the data. Due to the duration of the study (25 mo) a significant aging component was taken into account during analysis. Several metabolites were correlated with aging in elk inoculated with CWD, but not in the control group.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».