MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2005463740 · doi:10.1042/bj20051197

Catabolism of endogenous and overexpressed APH1a and PEN2: evidence for artifactual involvement of the proteasome in the degradation of overexpressed proteins

2006· article· en· W2005463740 sur OpenAlexaff
Julie Dunys, Toshitaka Kawarai, Sherwin Wilk, Peter St George‐Hyslop, Cristine Alvès da Costa, Frédéric Checler

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueEuropean CommissionUniversity of Texas Southwestern Medical CenterJohns Hopkins University
Mots-clésLactacystinProteasomeEndogenyProteolysisChemistryBiologyCell biologyProteasome inhibitorMolecular biologyBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PS (presenilin)-dependent gamma-secretase occurs as a high-molecular-mass complex composed of either PS1 or PS2 associated with Nct (nicastrin), PEN2 (presenilin enhancer 2 homologue) and APH1 (anterior pharynx defective 1 homologue). Numerous reports have documented the very complicated physical and functional cross-talk between these proteins that ultimately governs the biological activity of the gamma-secretase, but very few studies examined the fate of the components of the complex. We show that, in both HEK-293 cells and the TSM1 neuronal cell line, the immunoreactivities of overexpressed myc-tagged-APH1a and -PEN2 were enhanced by the proteasome inhibitors ZIE and lactacystin, whereas a broad range of protease inhibitors had no effect. By contrast, proteasome inhibitors were totally unable to affect the cellular expression of endogenous APH1aL and PEN2 in HEK-293 cells, TSM1 and primary cultured cortical neurons. To explain this apparent discrepancy, we examined the degradation of myc-tagged-APH1a and -PEN2, in vitro, by cell extracts containing endogenous proteasome and by purified 20S proteasome. Strikingly, myc-tagged-APH1a and -PEN2 resist proteolysis by endogenous proteasome and purified 20S proteasome. We also show that endogenous PEN2 expression was drastically higher in wild-type than in PS- and Nct-deficient fibroblasts and was enhanced by proteasome inhibitors only in the two deficient cell systems. However, here again, purified 20S proteasome appeared unable to cleave endogenous PEN2 present in PS-deficient fibroblasts. The levels of endogenous APH1aL-like immunoreactivity were not modified by proteasome inhibitors and were unaffected by PS deficiency. Altogether, our results indicate that endogenous PEN2 and APH1aL do not undergo proteasomal degradation under physiological conditions in HEK-293 cells, TSM1 cells and fibroblasts and that the clearance of PEN2 in PS- and Nct-deficient fibroblasts is not mediated by 20S proteasome. Whether the 26S proteasome participates to PEN2 proteolysis in deficient fibroblasts remains to be established.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemical JournalMême sujetCancer-related gene regulationTravaux en français237 207