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Enregistrement W2005482333 · doi:10.1139/cjm-46-6-584

Mutational analysis of the C-terminal anchoring domains of <i>Streptococcus mutans</i> P1 antigen: Role of the LPXTGX motif in P1 association with the cell wall

2000· article· en· W2005482333 sur OpenAlexaffvenue
Song F. Lee, Lingqiu Gao

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantMolecular biologyStreptococcus mutansBiologyCytoplasmWild typeCell wallBiochemistryChemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The salivary agglutinin-interacting adhesin P1 of Streptococcus mutans is anchored to the cell wall via the carboxy (C) terminus, which contains a wall-associated domain, a conserved LPXTGX motif, a hydrophobic domain, and a charged tail. To further investigate the role of the C-terminal anchoring regions in cell wall sorting and anchoring, mutational analysis was performed on P1 in this study. Three truncated P1 mutants and seven site-directed mutants were generated by a polymerase chain reaction-based technique. The mutated P1 genes were returned to the P1-negative S. mutans SM3352 for expression and localization studies by ELISA and Western immunoblotting. The results showed that P1 mutants with deletion of the hydrophobic domain and charged tail, or deletion of the charged tail alone resulted in the secretion of P1 to the culture medium. Results from cellular fractionation experiments with the truncated mutants showed that P1 was not trapped in the membrane or cytoplasm. The site-directed mutants showed normal distribution of P1 to the cell surface as compared to the wild-type. However, when cell walls prepared from the site-directed mutants were boiled with SDS, P1 could be removed readily from the mutants with Thr residue in the LPNTGV motif, altered to either Ser (T1531S) or Phe (T1531F); the mutant with Thr and Gly residues altered to two Phe residues (TG1531-1532FF), and the LPNTGV-deleted mutant (LPNTGV-). In contrast, the wild-type P1 and the other three site-directed P1 mutants (P1529V, N1530I, and G1532F) could not be removed by boiling SDS. When the cell wall P1s from the wild-type, mutants P1529V, N1530I, and G1532F were reacted with an antibody directed against the hydrophobic domain and charged tail, no reaction was detected. However, P1s from mutants T1531S, T1531F, TG1531-1532FF, and LPNTGV- were recognized by the antibody, indicating that the inability of these mutated P1s to firmly link to the cell wall was the result of failure in proteolytic cleavage of the hydrophobic domain and charged tail. In summary, the results suggest that the charged tail plays a decisive role in sorting P1 to the cell surface, while the LPXTGX motif determines the nature of P1-cell wall association. The Thr residue of the LPXTGX motif is required for enzymatic processing to link P1 to the cell wall, presumably via a covalent bond.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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