Transcriptional and Epigenetic Modulation of Human Rhinovirus–Induced CXCL10 Production by Cigarette Smoke
Notice bibliographique
Résumé
Human rhinovirus (HRV) triggers exacerbations of asthma and chronic obstructive pulmonary disease. Cigarette smoking is the primary risk factor for the development of chronic obstructive pulmonary disease, and 25% of individuals with asthma smoke. Smokers experience both longer and more severe colds. We previously showed that cigarette smoke extract (CSE) inhibited HRV-induced expression of a range of epithelial antiviral molecules. Here, we use CXCL10 as a model antiviral gene to examine the mechanisms by which CSE inhibits epithelial antiviral immunity. HRV-induced CXCL10 transcription depends on activation of NF-ĸB and IFN-regulatory factor-1 (IRF-1), and we now also implicate two signal transducer and activator of transcription (STAT) consensus sequences in the CXCL10 promoter in HRV-induced CXCL10 expression. CSE inhibited HRV-induced activation and nuclear translocation/binding of both NF-ĸB, and IRF-1 to their respective recognition sequences in the CXCL10 promoter. HRV also induced formation of complexes at the STAT region in the CXCL10 promoter, and HRV-induced activation of STAT-1 was inhibited by CSE. In addition, CSE inhibited HRV-induced chromatin accessibility around the transcriptional start site of the CXCL10 promoter. Although CSE inhibited HRV-induced expression of both the viral double-stranded RNA sensors, retinoic acid-inducible gene-I and melanoma differentiation-associated gene (MDA) 5, only specific short interfering RNA (siRNA) to MDA5, but not nontargeting siRNA, or siRNA to retinoic acid-inducible gene-I, inhibited HRV-induced CXCL10 induction. We conclude that CSE reduces chromatin accessibility and inhibits viral signaling via NF-ĸB, IRF-1, STAT-1, and MDA5. Thus, we show that CSE can simultaneously modulate multiple pathways linked to innate immune responses to HRV infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».