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Enregistrement W2005701276 · doi:10.1002/jez.495

Phosphoglycerate kinase 1 expression responds to freezing, anoxia, and dehydration stresses in the freeze tolerant wood frog, <i>Rana sylvatica</i>

2008· article· en· W2005701276 sur OpenAlexafffund
Shaobo Wu, Janet M. Storey, Kenneth B. Storey

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Zoology Part A Ecological Genetics and Physiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Exeter
Mots-clésBiologyGlycolysisXenopusDehydrationBiochemistryRanaAmino acidAmphibianCell biologyMolecular biologyEnzymeGeneAnatomyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Natural freezing survival by wood frogs (Rana sylvatica) involves multiple organ-specific changes in gene expression. Screening of a cDNA library made from brain of frozen frogs revealed freeze-responsive up-regulation of the glycolytic enzyme, phosphoglycerate kinase 1 (PGK1). Northern blots showed an approximately two-fold increase in pgk1 transcripts in brain of frozen frogs whereas PGK1 protein levels rose by three- to five-fold within 4-8 hr of freezing. Freezing also elevated pgk1 transcripts in liver but not in skin. Both transcript and protein levels also rose in response to two of the component stresses of freezing (anoxia and dehydration) with a particularly pronounced (11-fold) increase in PGK1 protein in brain in response to anoxia. Amino acid sequence analysis showed 92.5% identity between wood frog and Xenopus laevis PGK1 and 86-88% identity with the zebrafish, chicken, and human protein. Four unique amino acid substitutions in the wood frog protein could be important in maintaining the functional conformation of the wood frog protein at low body temperatures. Elevated amounts of PGK1, one of the ATP-generating reactions of glycolysis, in wood frog brain during freezing would enhance the glycolytic capacity of the organ and support the maintenance of cellular energetics under the ischemic conditions of the frozen state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,580
Score d'incertitude au seuil0,421

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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