Phosphoglycerate kinase 1 expression responds to freezing, anoxia, and dehydration stresses in the freeze tolerant wood frog, <i>Rana sylvatica</i>
Notice bibliographique
Résumé
Natural freezing survival by wood frogs (Rana sylvatica) involves multiple organ-specific changes in gene expression. Screening of a cDNA library made from brain of frozen frogs revealed freeze-responsive up-regulation of the glycolytic enzyme, phosphoglycerate kinase 1 (PGK1). Northern blots showed an approximately two-fold increase in pgk1 transcripts in brain of frozen frogs whereas PGK1 protein levels rose by three- to five-fold within 4-8 hr of freezing. Freezing also elevated pgk1 transcripts in liver but not in skin. Both transcript and protein levels also rose in response to two of the component stresses of freezing (anoxia and dehydration) with a particularly pronounced (11-fold) increase in PGK1 protein in brain in response to anoxia. Amino acid sequence analysis showed 92.5% identity between wood frog and Xenopus laevis PGK1 and 86-88% identity with the zebrafish, chicken, and human protein. Four unique amino acid substitutions in the wood frog protein could be important in maintaining the functional conformation of the wood frog protein at low body temperatures. Elevated amounts of PGK1, one of the ATP-generating reactions of glycolysis, in wood frog brain during freezing would enhance the glycolytic capacity of the organ and support the maintenance of cellular energetics under the ischemic conditions of the frozen state.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».