Statistical Learning With Time Series Dependence: An Application to Scoring Sleep in Mice
Notice bibliographique
Résumé
We develop methodology which combines statistical learning methods with generalized Markov models, thereby enhancing the former to account for time series dependence. Our methodology can accommodate very general and very long-term time dependence structures in an easily estimable and computationally tractable fashion. We apply our methodology to the scoring of sleep behavior in mice. As currently used methods are expensive, invasive, and labor intensive, there is considerable interest in high-throughput automated systems which would allow many mice to be scored cheaply and quickly. Previous efforts have been able to differentiate sleep from wakefulness, but they are unable to differentiate the rare and important state of REM sleep from non-REM sleep. Key difficulties in detecting REM are that (i) REM is much rarer than non-REM and wakefulness, (ii) REM looks similar to non-REM in terms of the observed covariates, (iii) the data are noisy, and (iv) the data contain strong time dependence structures crucial for differentiating REM from non-REM. Our new approach (i) shows improved differentiation of REM from non-REM sleep and (ii) accurately estimates aggregate quantities of sleep in our application to video-based sleep scoring of mice.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».