Abstract 4923: Myofibroblasts induce specific epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) patterns in colorectal cancer cells by enhanced secretion of bone morphogenic protein (BMP) inhibitors
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) is dictated by both cell-autonomous and stromal oncogenic signals. We hypothesized that colon cancer desmoplasia provides multiple signals, inducing EMT in cancer cells. To address this issue, we first developed cell-contact cocultures of SW480 and SW620 cell lines with normal fibroblasts. Cocultured fibroblasts (myofibroblasts) acquired the myofibroblastic phenotype with increased alpha-SMA and MMP2 expression, which was reversed by TGF-beta disruption. We identified oncogenic signals from myofibroblasts, after subjecting mono- and cocultures to secretome analysis with mass spectrometry (LC-MS/MS). In a total of 1551 identified proteins (>2 peptides), a) secretome algorithms based on prediction of secretion, were deployed, allowing the removal of intracellular contaminants from the generated coculture lists and b) monoculture datasets were used as exclusion datasets to denote the non-specific-to-desmoplasia proteins. Subsequent bioinformatic analysis in this “desmoplastic” dataset (124 proteins) was used for protein clustering and recovery of a potential EMT cluster. We deployed: a) Ingenuity pathway analysis, b) Gene ontology, c) Smooth muscle enrichment analysis with Genevestigator d) Protein-protein interaction network analysis with STRING. Interestingly, this integration revealed GREM1, FST and FSTL3, three Bone Morphogenic Protein (BMP) inhibitors, as potent MET disruptors in colorectal cancer. We thus hypothesized that cancer cells recruit stromal fibroblasts to disrupt unfavorable BMP signaling (through generation of multiple BMP inhibitors), which supports a cancer cell undifferentiated state. To test this, a colon cancer cell line (HT29; active BMP signaling), was treated with human BMP7 and decreased cell migration (p<0.05) and proliferation (p<0.05) were shown. These lysates were further used for proteomic analysis (LC-MS/MS) with label-free quantitation to investigate differential protein expression. Using gene expression meta-analysis from fetal tissues, a significant (p<0.01) shift from mesenchymal to epithelial protein dominance was noticed, after 200 ng/mL BMP7 treatment. Differentially expressed proteins remain to be validated, to better characterize the “BMP-7-disrpuption” EMT signatures in colon cancer. In conclusion, integrative “systems biology” approaches may support the identification and validation of EMT signatures with important causative links to cancer. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 102nd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2011 Apr 2-6; Orlando, FL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2011;71(8 Suppl):Abstract nr 4923. doi:10.1158/1538-7445.AM2011-4923
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».