Population-based case-control study of alpha 1-antitrypsin and SLC11A1 in Crohnʼs disease and ulcerative colitis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC) are chronic inflammatory diseases of the digestive tract. Genetic factors and an abnormal immune response to infections are suspected to be involved in inflammatory bowel diseases. METHODS: In the present study 300 blood samples from CD patients (n = 100), UC patients (n = 100), and healthy controls (n = 100) were taken from a population-based case-control study. PCR assays and capillary electrophoresis were used to detect alpha 1 antitrypsin M, S, and Z alleles and the C-to-T transition at the -237 nucleotide position of the SLC11A1 promoter. Additionally, length polymorphism of (gt)n alleles in the promoter region and TGTG and CAAA insertion/deletion in the untranslated region (3' UTR) of the SLC11A1 gene were evaluated. RESULTS: The Z allele only for AAT was associated (P < 0.05) with CD. No other significant results were detected for AAT alleles. For SLC11A1, alleles 1 and 2 were significant (P < 0.05) for UC, but only allele 3 was significant (P < 0.05) for CD. There was a significant (P < 0.05) association of a CAAA insertion with CD but not for deletion in the 3' UTR. No differences (P < 0.05) were detected for TAAA. CONCLUSIONS: Because AAT and SLC11A1 proteins directly or indirectly function as inhibitors of human leukocyte elastase, mutations in the AAT and SLC11A1 genes may change the balance between elastase produced by leukocytes during phagocytosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».