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Enregistrement W2005920738 · doi:10.4028/www.scientific.net/amr.810.77

Advances in Molecular Technologies and Platforms for the Diagnosis of Infectious Diseases

2013· article· en· W2005920738 sur OpenAlexaff
Mohammad R. Hasan

Notice bibliographique

RevueAdvanced materials research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueBacterial Infections and Vaccines
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiagnostic testInfectious disease (medical specialty)Molecular diagnosticsNucleic acidPolymerase chain reactionPathogenBiologyNucleic Acid Amplification TestsNucleic acid detectionNASBAInfectious agentComputational biologyDiseaseBiotechnologyMedicineVirologyMicrobiologyBioinformaticsPathologyGeneticsDNANucleic acid sequenceVeterinary medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

nfectious microbial pathogens constitute the largest cause of morbidity and mortality worldwide. Early diagnosis and rapid infection control measures can lead to improved outcomes, earlier discharges and reduced nosocomial infections. Conventional diagnostic methods for infectious diseases such as microscopy, culture, and immunological methods, in most cases, are not universally applicable, less sensitive and could take from days to months to complete depending on the pathogen. Molecular assays based on nucleic acids such as polymerase chain reaction (PCR) have improved the sensitivity, specificity and turn-around time in diagnostic microbiology laboratories. These tests are particularly important to detect very low levels of pathogens in clinical samples, and for organisms that have long half-lives or are non-culturable. However, individual molecular tests are available for only a limited number of the more common infectious agents. Moreover, infectious disease events arising from novel pathogens or genetic variants have significantly increased, recently, for which, routine diagnostic methods are not yet available. Therefore, molecular methods and technologies capable of detecting multiple pathogens in a single test have become available over the last few years. Although, these methods are based on the conventional nucleic acid amplification and hybridization chemistry, enhanced multiplexing capability has been achieved through innovations in nucleic acid labeling techniques, and post-amplification analytic methods and instrumentation. The availability of these test kits brought a new level of convenience to the physicians ordering practices, and to the laboratory personnel, as they require very little hands on time. However, these tests are yet unaffordable to many laboratories, and in many cases, the sensitivity is poor compared to that of single-target, real-time PCR assays. Looking into the future, the revolutionary, next generation sequencing (NGS) technology is now being considered as a potential method for rapid identification of hundreds of pathogens, in an unbiased manner, with a single test that could significantly benefit patients who are critically ill with undiagnosed disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,222

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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