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Enregistrement W2006033598 · doi:10.1158/1538-7445.cansusc14-12

Abstract 12: Germline BRCA mutations in an unselected cohort of patients with pancreatic adenocarcinoma

2014· article· en· W2006033598 sur OpenAlexaffabout
Spring Holter, Ayelet Borgida, Anna Dodd, Steven A. Narod, Mohammad R. Akbari, Malcolm J. Moore, Steven Gallinger

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensWomen's College HospitalUniversity Health NetworkMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePancreatic cancerFamily historyGermline mutationGermlineOncologyBreast cancerAdenocarcinomaOvarian cancerCancerInternal medicineBRCA mutationGenetic testingGynecologyMutationGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This is the first prospective study to determine the frequency of BRCA1 and BRCA2 germline mutations in an unselected series of patients with pancreatic adenocarcinoma. Patients with histologically or clinically confirmed pancreatic adenocarcinoma were approached at a single cancer centre to enroll in the IRB-approved Ontario Pancreas Cancer Study. Patients provided informed consent and cancer family history data was obtained. Blood was collected and analyzed by Sanger sequencing and MLPA for germline variants in BRCA1 and BRCA2. All predicted deleterious germline variants were confirmed by a clinical laboratory on an independent blood sample. Pathogenic germline mutations were identified in 12/234 (5%) of unselected incident pancreatic adenocarcinomas. BRCA1 mutations accounted for 1.2% (3/234) and BRCA2 accounted for 3.8% (9/234) cases. For the cohort, average age of pancreatic adenocarcinoma diagnosis was 65 years (27-91) and 46% were female. Previous primary cancer was reported in 24% of cases and 12% were of Ashkenazi Jewish descent. A family history of breast and/or ovarian cancer was reported in 25% of cases; however, of these with a family history, 1/3 did not meet NCCN guidelines to warrant germline BRCA analysis. Pancreatic cancer in another relative was reported in 12% of cases. A personal history of a previous primary cancer diagnosis and a family history of breast and/or ovarian cancer were significantly associated with germline BRCA mutations. Previous studies of BRCA mutations in pancreatic adenocarcinoma have been limited to retrospective case series and incomplete germline analysis. Our study shows that germline BRCA mutations account for a significant proportion of pancreatic adenocarcinoma, regardless of family history of breast and ovarian cancer. Increased identification of patients with germline BRCA mutations and pancreatic adenocarcinoma may allow for tailored chemotherapy through the use of platinum agents or PARP inhibitors. Citation Format: Spring Holter, Ayelet Borgida, Anna Dodd, Steven Narod, Mohammad Akbari, Malcolm Moore, Steven Gallinger. Germline BRCA mutations in an unselected cohort of patients with pancreatic adenocarcinoma. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Cancer Susceptibility and Cancer Susceptibility Syndromes; Jan 29-Feb 1, 2014; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(23 Suppl):Abstract nr 12. doi:10.1158/1538-7445.CANSUSC14-12

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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