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Enregistrement W2006062762 · doi:10.1371/journal.pone.0026395

Non-Invasive Cytology Brush PCR Diagnostic Testing in Mucosal Leishmaniasis: Superior Performance to Conventional Biopsy with Histopathology

2011· article· en· W2006062762 sur OpenAlexafffund
Andrea K. Boggild, Braulio M. Valencia, Nicolás Veland, Ana Pilar Ramos, Flor Calderon, Jorge Arévalo, Donald E. Low, Alejandro Llanos‐Cuentas

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of TorontoToronto General Hospital
Organismes subventionnairesBelgisch OntwikkelingsagentschapRoyal SocietyRoyal Society of Tropical Medicine and HygieneUniversidad Peruana Cayetano HerediaRoyal College of Physicians and Surgeons of Canada
Mots-clésHistopathologyCytologyBiopsyMedicineCytopathologyPathologyLeishmaniasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Traditional methods of diagnosing mucosal leishmaniasis (ML), such as biopsy with histopathology, are insensitive and require collection of an invasive diagnostic specimen. METHODS: We compared standard invasive procedures including biopsy histopathology, biopsy PCR, and leishmanin skin test (LST) to a novel, non-invasive, cytology-brush based PCR for the diagnosis of ML in Lima, Peru. Consensus reference standard was 2/4 tests positive, and outcome measures were sensitivity and specificity. Leishmania species identification was performed by PCR-based assays of positive specimens. RESULTS: Twenty-eight patients were enrolled, 23 of whom fulfilled criteria for a diagnosis of ML. Sensitivity and specificity of biopsy with histopathology were 21.7% [95% CI 4.9-38.5%] and 100%; 69.6% [95% CI 50.8-88.4%] and 100% for LST; 95.7% [95% CI 87.4-100%] and 100% for biopsy PCR; and 95.7% [95% CI 87.4-100%] and 90% [95% CI 71.4-100%] for cytology brush PCR using both Cervisoft® and Histobrush® cervical cytology brushes. Represented species identified by PCR-RFLP included: L. (V). braziliensis (n = 4), and L. (V). peruviana (n = 3). CONCLUSIONS: Use of commercial grade cytology brush PCR for diagnosis of ML is sensitive, rapid, well tolerated, and carries none of the risks of invasive diagnostic procedures such as biopsy. Further optimization is required for adequate species identification. Further evaluation of this method in field and other settings is warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,955

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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