MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2006087781 · doi:10.1002/jms.1742

A novel liquid–liquid extraction and stable isotope dilution NCI‐GC‐MS method for quantitation of agmatine in postmortem brain cortex

2010· article· en· W2006087781 sur OpenAlexafffund
Gary Gang Chen, Gustavo Turecki, Orval Mamer

Notice bibliographique

RevueJournal of Mass Spectrometry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePolyamine Metabolism and Applications
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChemistryChromatographyIsotope dilutionAgmatineExtraction (chemistry)Gas chromatography–mass spectrometryLiquid–liquid extractionMass spectrometryBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The group of biologically important amines includes putrescine, spermidine and spermine, as well as agmatine, which is a guanidino-amine. There is considerable evidence supporting a role of these amines in the etiology and pathology of mental disorders. We have previously developed a quantitative GC-MS method for simultaneous measurement of three major polyamines to support our studies linking polyamines to mental disorders. However, a unique GC-MS method is required for agmatine. To efficiently extract agmatine from postmortem brain tissues, we developed an isopropanol based liquid-liquid extraction protocol using potassium carbonate as a salting-out agent which showed a much greater recovery than n-butanol used in earlier methods. The GC-MS analysis employed hexafluoroacetylacetone as derivatization reagent and was carried out using negative chemical ionization with total ion and selected ion monitoring. (15)N(4)-agmatine was synthesized from (15)N(4)-L-arginine and used as internal standard in a conventional stable isotope dilution assay. This method accurately measures the level of agmatine from very small quantities (10-20 mg) of postmortem brain tissue, with a quantitation limit down to 1 ng/g of wet tissue. The limit of detection is 0.01 ng/g of wet tissue.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,146
Score d'incertitude au seuil0,396

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Mass SpectrometryMême sujetPolyamine Metabolism and ApplicationsTravaux en français237 207