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Enregistrement W2006195944 · doi:10.1186/1755-8794-6-19

Genotype-driven recruitment: a strategy whose time has come?

2013· article· en· W2006195944 sur OpenAlexaff
Isabelle Budin‐Ljøsne, Kaitlin J. Soye, Anne Marie Tassé, Bartha Maria Knoppers, Jennifer R. Harris

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genomics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNorges ForskningsrådEuropean Commission
Mots-clésBiobankGenotypingGenotypeData sciencePsychologyPublic relationsEngineering ethicsPolitical scienceBiologyComputer scienceBioinformaticsGeneticsEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Genotype-Driven Recruitment (GDR) is a research design that recruits research participants based on genotype rather than based on the presence or absence of a particular condition or clinical outcome. Analyses of the ethical issues of GDR studies, and the recommendations derived from these analyses, are based on GDR research designs that make use of genetic information already collected in previous studies. However, as genotyping becomes more affordable, it is expected that genotypic information will become a common part of the information stored in biobanks and held in health care records. Furthermore, individuals will increasingly gain knowledge of their own genotypes through Direct-to-Consumer services. One can therefore foresee that individuals will be invited to participate not only in follow-up GDR studies but also in original GDR studies because genetic information about them is available. These individuals may or may have not participated in research before and may or may not be aware that their genetic information is available for research. DISCUSSION: From a conceptual point of view, we investigate whether the current ethics-related recommendations for the conduct of GDR suffice for a broader array of circumstances under which genetic information can be available. Our analysis reveals that the existing recommendations do not suffice for a broader use of GDR. SUMMARY: Our findings refocus attention on ethical issues which are neither new nor specific to GDR but which place greater demand on coordinated solutions. These challenges and approaches for addressing them are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,366
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,471
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,634
Score d'incertitude au seuil0,782

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3660,471
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0060,011
Communication savante0,0150,025
Science ouverte0,0070,013
Intégrité de la recherche0,0160,018
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0220,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,550
Tête enseignante GPT0,511
Écart entre enseignants0,040 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
DomaineMéthodes
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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