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Enregistrement W2006264276 · doi:10.1080/15412550801940457

Profiling of mRNA Expression in Quadriceps of Patients with COPD and Muscle Wasting

2008· article· en· W2006264276 sur OpenAlexaff
Richard Debigaré, François Maltais, Claude H. Côt́e, Annie Michaud, Marc‐André Caron, Mahroo Mofarrahi, Pierre Leblanc, Sabah N. A. Hussain

Notice bibliographique

RevueCOPD Journal of Chronic Obstructive Pulmonary Disease · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensMcGill UniversityRoyal Victoria HospitalUniversité LavalCentre hospitalier de l'Université LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCOPDWastingMuscle atrophyMedicineMessenger RNAInternal medicinePathogenesisEndocrinologyGene expressionSarcopeniaSkeletal muscleBioinformaticsBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Peripheral muscle wasting is a feature of chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Potent therapeutic strategies are needed to improve peripheral muscle mass in these patients. We hypothesized that the evaluation of the mRNA expression profile of quadriceps muscle could be useful in identifying key biochemical pathways involved in the wasting process. We monitored mRNA expression profile of quadriceps muscle in four patients with COPD with muscle atrophy (age: 71.3 +/- 2.1 years, mean SD; FEV(1) 28.3 +/- 10.8 % predicted) and four control subjects (age: 66.5 +/- 1.3 years) using HuU95v2 gene chips. Fifty-seven mRNAs transcripts (0.5%) were found to be differentially expressed in muscles of COPD patients (i.e., p < 0.01). Among them, forkhead box O -1 and -3 and insulin-like growth factor-1 expressions being significantly elevated in COPD subjects. Concomitantly, a significant reduction in mRNA expression of two myofilament proteins was observed. Energy production appears to be impaired as indicated by the significant rise in nicotinamide N-methyltransferase mRNA expression. This study provides for the first time evidence that genes are selectively expressed in limb muscles of COPD patients and further research need to focus on their functional roles in the pathogenesis of muscle dysfunction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,161
Score d'incertitude au seuil0,386

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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